Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm27029A2A4P4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm27029A2A4P4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms