Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm6268A2A3U9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6268A2A3U9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms