Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc173A0JLY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms