Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI67

Frmpd2, FERM and PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd2A0A140LI67 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd2A0A140LI67 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd2A0A140LI67 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms