Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms