Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd8B9EJ80 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzd8B9EJ80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzd8B9EJ80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdzd8B9EJ80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms