Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Col4a3Q9QZS0 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Col4a3Q9QZS0 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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