Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Cln8Q9QUK3 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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