Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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