Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc47Q9D024 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc47Q9D024 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms