Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rprd1bQ9CSU0 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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