Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Smim11aQ99J19 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Smim11aQ99J19 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms