Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms