Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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Trappc1Q5NCF2 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Trappc1Q5NCF2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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