Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Shank3Q4ACU6 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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