Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm28047Q3US59 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms