Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ctdnep1Q3TP92 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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