Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Trim71Q1PSW8 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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