Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms