Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Hoxc4Q08624 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxc4Q08624 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms