Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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H2-Eb1P04230 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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H2-Eb1P04230 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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H2-Eb1P04230 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
H2-Eb1P04230 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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