Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms