Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm20795J3QP49 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Gm20795J3QP49 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms