Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Spocd1B1ASB6 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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