Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nphp1Q9QY53 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms