Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc3Q9D6Y1 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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