Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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