Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Zbed3Q9D0L1 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Zbed3Q9D0L1 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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