Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms