Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ubxn4Q8VCH8 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms