Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NipblQ6KCD5 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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