Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Sft2d1Q5SSN7 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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