Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Shank3Q4ACU6 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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