Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Usp48Q3V0C5 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Usp48Q3V0C5 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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Usp48Q3V0C5 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp48Q3V0C5 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Usp48Q3V0C5 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Usp48Q3V0C5 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Usp48Q3V0C5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Usp48Q3V0C5 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp48Q3V0C5 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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