Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnf149Q3U2C5 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms