Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctdnep1Q3TP92 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctdnep1Q3TP92 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms