Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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