Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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ptchd1Q14B62 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ptchd1Q14B62 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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