Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms