Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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