Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VdrP48281 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VdrP48281 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms