Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtprmP28828 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PtprmP28828 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtprmP28828 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms