Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
H2-Eb1P04230 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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