Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CopeO89079 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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CopeO89079 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CopeO89079 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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CopeO89079 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CopeO89079 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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CopeO89079 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CopeO89079 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CopeO89079 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
CopeO89079 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CopeO89079 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CopeO89079 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CopeO89079 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CopeO89079 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CopeO89079 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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