Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DffaO54786 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DffaO54786 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
DffaO54786 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DffaO54786 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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