Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms