Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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