Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B633

Trav8n-2, T cell receptor alpha variable 8n-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8n-2A0A075B633 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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Trav8n-2A0A075B633 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trav8n-2A0A075B633 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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