Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Hdac6Q9Z2V5 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hdac6Q9Z2V5 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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