Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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